So ähnlich mache ich es auch. Fundament bei mir ist eine H3-Complete-Installation, die ich seit XP-Zeiten unverändert von Rechner zu Rechner kopiert (nicht neu installiert) habe. Das klappt, weil H3 keine langen Litaneien in die Registry schreibt.
Diese Installation wird nicht angetastet, sondern wie Andrean schreibt, 1:1 kopiert und als Basis für die Erweiterungen genutzt. Geht da mal was schief, probiert man es eben noch mal.
Übrigens: bei mir hat sich ein Virenscanner über die "internal tool-exe" bei HotA beschwert. Hat jemand ähnliche Erfahrungen gemacht?